RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PTGESO14684 152 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 INPPL1O15357 1258 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC1A1P43005 524 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 LHX1P48742 406 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TUSC3Q13454 348 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL23Q86XA0 190 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 PALB2Q86YC2 1186 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 ABI1Q8IZP0 508 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 UBXN4Q92575 508 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA1Q92805 767 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-212ENST00000591041 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 RFC2P35250 354 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 LILRA4P59901 499 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 AMPD2Q01433 879 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MON1BQ7L1V2 547 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PASD1Q8IV76 773 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFP42Q96MM3 310 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CARD6Q9BX69 1037 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SDCBP2Q9H190 292 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 HIPK3Q9H422 1215 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 C9IYK1 514 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO1FO00160 1098 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB561D2O14569 222 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MGEA5O60502 916 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ODC1P11926 461 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP8P22894 467 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SCNN1GP51170 649 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM189BP81408 668 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC57Q8N9N7 239 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 WNT8AQ9H1J5 351 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 FTCDO95954 541 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBBP07437 444 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC24Q6P3W2 148 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 LPPQ93052 612 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 M0QYV0 167 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SPOPO43791 374 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PCSK1P29120 753 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 GJA8P48165 433 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYBG2Q8N1P7 616 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 WHAMMQ8TF30 809 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC66A2RUB6 948 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 O00370 1275 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAPPC3O43617 180 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ITIH3Q06033 890 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MESDQ14696 234 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 C18orf8Q96DM3 657 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TLR10Q9BXR5 811 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CYLDQ9NQC7 956 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ANAPC7Q9UJX3 599 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIP11Q15643 1979 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 PPEF2O14830 753 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCGO15287 622 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 MICAL2O94851 1124 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 RRM1P23921 792 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 CETN2P41208 172 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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