RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 GPR15P49685 360 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CCDC142Q17RM4 750 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ITIH5Q86UX2 942 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 RIN3Q8TB24 985 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 GIPC2Q8TF65 315 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 POMGNT1Q8WZA1 660 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SAAL1Q96ER3 474 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CLIC6Q96NY7 704 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TASP1Q9H6P5 420 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 DSEQ9UL01 958 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.07□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 A0A087X0B3 334 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 DPYSL4O14531 572 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FGF19O95750 216 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PAX3P23760 479 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ABCD1P33897 745 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CXCL12P48061 93 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FNTBP49356 437 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 RESTQ13127 1097 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 VEPH1Q14D04 833 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PON2Q15165 354 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 BPIFB1Q8TDL5 484 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HVCN1Q96D96 273 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CHFRQ96EP1 664 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MSANTD3Q96H12 275 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 FAM213AQ9BRX8 229 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SLC46A2Q9BY10 475 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 OBP2AQ9NY56 170 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 STK17AQ9UEE5 414 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 USP18Q9UMW8 372 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CCL26Q9Y258 94 aa13.06□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 KPNA7A9QM74 516 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HRO43593 1189 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HCRTO43612 131 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CDC25CP30307 473 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TUFMP49411 452 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 NRLP54845 237 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SPEM2Q0P670 501 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CCINQ13939 588 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 LRRC32Q14392 662 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SV2CQ496J9 727 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 METTL23Q86XA0 190 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CXorf38Q8TB03 319 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 L1RE1Q9UN81 338 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 EML5Q05BV3 1969 aa13.05□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 MYO16Q9Y6X6 1858 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA8IPA6NC78 632 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA8JA6NMD2 632 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TADA3O75528 432 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 IL18RAPO95256 599 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 GCNT3O95395 438 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ITGB3P05106 788 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 WEE1P30291 646 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 NLRP12P59046 1061 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 LMNB2Q03252 620 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 PPP2R5DQ14738 602 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 TRIM68Q6AZZ1 485 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CMTM8Q8IZV2 173 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTIF-208ENST00000590422 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms