RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 VAMP7P51809 220 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MYL6P60660 151 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MTSS1LQ765P7 747 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CEP72Q9P209 647 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ASB3Q9Y575 518 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MUC3AQ02505 3323 aa20.26■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 IKBKBO14920 756 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MAPK13O15264 365 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PPP1R2P41236 205 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 NCOA4Q13772 614 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GDE1Q9NZC3 331 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.25■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PSMA7O14818 248 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SOAT2O75908 522 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 AKAP3O75969 853 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 VNN2O95498 520 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PDGFRBP09619 1106 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 P4HA1P13674 534 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 DLG4P78352 724 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CLDN10P78369 228 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF699Q32M78 642 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SPATA20Q8TB22 786 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CDH9Q9ULB4 789 aa20.24■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GABRDO14764 452 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MICAL2O94851 1124 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 FGF19O95750 216 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 FAM163BP0C2L3 166 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 OSTM1Q86WC4 334 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SYT15Q9BQS2 421 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.23■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 STX10O60499 249 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PIK3CAP42336 1068 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SV2AQ7L0J3 742 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ADSSL1Q8N142 457 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GIPC2Q8TF65 315 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 PSMG2Q969U7 264 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GCNAQ96QF7 691 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GPR88Q9GZN0 384 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.22■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 A8MXQ7 604 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 ANHXE9PGG2 379 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 BIN1O00499 593 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 TACC1O75410 805 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CEBPBP17676 345 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 COL9A1P20849 921 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 LMO2P25791 158 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 GCLMP48507 274 aa20.21■□□□□ 0.83
GIPC1-210ENST00000589497 CYP27A1Q02318 531 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.1 ms