RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT3Q9UH03 358 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 TKFCQ3LXA3 575 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SYTL3Q4VX76 610 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RARBP10826 455 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CPA2P48052 419 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K14Q99558 947 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CD274Q9NZQ7 290 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB12Q96P63 405 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ELP3Q9H9T3 547 aa22.27■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 UNC13BO14795 1591 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 VHLP40337 213 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DEFA1P59665 94 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DEFA3P59666 94 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MROH9Q5TGP6 573 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FAM162AQ96A26 154 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 KRT16P08779 473 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42EP1Q00587 391 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA13PA6NCF6 341 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LAMB3Q13751 1172 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DYRK4Q9NR20 520 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.158e-6■■□□□ 11.6
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GW55 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC7Q99615 494 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DUX4Q9UBX2 424 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf58C9J3I9 102 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ACADSBP45954 432 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 IPMKQ8NFU5 416 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RBP3P10745 1247 aa22.25■■□□□ 1.15
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PTPRM-211ENST00000580170 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF263O14978 683 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ACADSP16219 412 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 EFHBQ8N7U6 833 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PIDD1Q9HB75 910 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC3Q13217 504 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RIT2Q99578 217 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CD4P01730 458 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 IL31Q6EBC2 164 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CALML6Q8TD86 181 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 PKP3Q9Y446 797 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CHRNA5P30532 468 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 FNTAP49354 379 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 STX19Q8N4C7 294 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC3O43617 180 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 KRT34O76011 436 aa22.24■■□□□ 1.15
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PTPRM-211ENST00000580170 KCNB2Q92953 911 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ENTPD3O75355 529 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 CAMTA2O94983 1202 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM16LQ309B1 348 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF6Q58WW2 860 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 SLC37A4O43826 429 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 BLVRAP53004 296 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 VCPKMTQ9H867 229 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRM-211ENST00000580170 AFF2P51816 1311 aa22.23■■□□□ 1.15
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