RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 SLC7A5Q01650 507 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 PAK2Q13177 524 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF560Q96MR9 790 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC66A2RUB6 948 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 M0QYV0 167 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 KRIT1O00522 736 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 AADACL2Q6P093 401 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 HACE1Q8IYU2 909 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 LPPQ93052 612 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 O00370 1275 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 CTNNA2P26232 953 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SPTLC1O15269 473 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PROSCO94903 275 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 CYP3A5P20815 502 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 MLH1P40692 756 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 LPIN1Q14693 890 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 CNGA2Q16280 664 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 C12orf29Q8N999 325 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 KPNA7A9QM74 516 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 ERLIN1O75477 346 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PNPLA4P41247 253 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TAF6P49848 677 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 ACOT1Q86TX2 421 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GAD1Q99259 594 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 NME7Q9Y5B8 376 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 A0A1W2PQY0 241 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 MGEA5O60502 916 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 MCM3P25205 808 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SLC1A1P43005 524 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 UBA3Q8TBC4 463 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 MCEEQ96PE7 176 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TRIM17Q9Y577 477 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PYGMP11217 842 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PRMT2P55345 433 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SV2CQ496J9 727 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 CPXM1Q96SM3 734 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SYNCQ9H7C4 482 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 RWDD2BP57060 319 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 STIM2Q9P246 746 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 USTQ9Y2C2 406 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 GPD2P43304 727 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 FAM26DQ5JW98 314 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 RNF169Q8NCN4 708 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 C3orf20Q8ND61 904 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 C18orf8Q96DM3 657 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 A8MXQ7 604 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC188H7C350 402 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 HCRTO43612 131 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-212ENST00000568900 LRPAP1P30533 357 aa22.09■■□□□ 1.13
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