RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.03■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.03■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 ANKRD7Q92527 254 aa20.03■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 GOLGA1Q92805 767 aa20.03■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 INPPL1O15357 1258 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 HCRTO43612 131 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 CYP1A2P05177 515 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 SGO2Q562F6 1265 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 ACOT1Q86TX2 421 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 C12orf29Q8N999 325 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 APBB2Q92870 758 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 PSMB7Q99436 277 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 TBX21Q9UL17 535 aa20.02■□□□□ 0.8
INO80E-211ENST00000567987 A8MXQ7 604 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CYB561D2O14569 222 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TUSC3Q13454 348 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 UNC93AQ86WB7 457 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.02■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 O00370 1275 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ZNF185O15231 689 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CXCL10P02778 98 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PDGFRBP09619 1106 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 RRM1P23921 792 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 LMO2P25791 158 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 DNA2P51530 1060 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TCEAL1Q15170 157 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CNGA2Q16280 664 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 DAAM2Q86T65 1068 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TRIM11Q96F44 468 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 SENP8Q96LD8 212 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 NUP85Q9BW27 656 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 TLR10Q9BXR5 811 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 LHX5Q9H2C1 402 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 SNX25Q9H3E2 840 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CEP83Q9Y592 693 aa20.01■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CTAGE15A4D2H0 777 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 MICAL2O94851 1124 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CTAGE8P0CG41 777 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 MYBL1P10243 752 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PTP4A2Q12974 167 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PTPROQ16827 1216 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CTAGE6Q86UF2 777 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CTAGE4Q8IX94 777 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 LPIN3Q9BQK8 851 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 SNX12Q9UMY4 172 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 B3GAT3O94766 335 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PARNO95453 639 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CLTBP09497 229 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 MMP8P22894 467 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 MEI1Q5TIA1 1274 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 WSCD1Q658N2 575 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 OSTM1Q86WC4 334 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ZNF280BQ86YH2 543 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 EPC1Q9H2F5 836 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CYTH4Q9UIA0 394 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 M0QYV0 167 aa19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 B4GALT3O60512 393 aa19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 WARSP23381 471 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 CXCR5P32302 372 aa19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 DSTYKQ6XUX3 929 aa19.99■□□□□ 0.79
INO80E-211ENST00000567987 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms