RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRB-209ENST00000550857 TUSC3Q13454 348 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRB-209ENST00000550857 RASEFQ8IZ41 740 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 ABCG4Q9H172 646 aa8.44□□□□□ -1.06
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