RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546804.1

AC004801.5-202, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 530 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-202ENST00000546804 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.8■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.8■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.8■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 EPOPA6NHQ4 379 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 LRRC53A6NM62 1247 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TPM1P09493 284 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 KRT5P13647 590 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PCSK1P29120 753 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 USP8P40818 1118 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PTPN14Q15678 1187 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PSMD5Q16401 504 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ZNF394Q53GI3 561 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SLC4A11Q8NBS3 891 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ZNF576Q9H609 170 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TLR9Q9NR96 1032 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 MTRRQ9UBK8 725 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CDH9Q9ULB4 789 aa18.79■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 OR6C75A6NL08 312 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 C2CD2LO14523 706 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 FSCN2O14926 492 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CYP26A1O43174 497 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CXCL14O95715 111 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PAEPP09466 180 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CLCN1P35523 988 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 KRT9P35527 623 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ORC1Q13415 861 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TMC7Q7Z402 723 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ACOT1Q86TX2 421 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SPC24Q8NBT2 197 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TNIP3Q96KP6 325 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TCF25Q9BQ70 676 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SYT15Q9BQS2 421 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 RXFP1Q9HBX9 757 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 IRAK3Q9Y616 596 aa18.78■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 MFAP3LO75121 409 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 GFPT2O94808 682 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ARID5BQ14865 1188 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CNGA4Q8IV77 575 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 TMEM209Q96SK2 561 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 PKMYT1Q99640 499 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 DNAI2Q9GZS0 605 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 FNIP2Q9P278 1114 aa18.77■□□□□ 0.6
AC004801.5-202ENST00000546804 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 ATP2C2O75185 946 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 FERP16591 822 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 BPIFB4P59827 614 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 TSPY1Q01534 308 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 CREMQ03060 361 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 FAM171BQ6P995 826 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 DNAJC7Q99615 494 aa18.76■□□□□ 0.59
AC004801.5-202ENST00000546804 KIAA1257Q9ULG3 409 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms