RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542100.5

E2F6-211, Transcript of E2F transcription factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F6, Length 3,450 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6-211ENST00000542100 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.04■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.04■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 CD48P09326 243 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 CXCL8P10145 99 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 TAF5Q15542 800 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 MAPK6Q16659 721 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 Q3C1V9 767 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 ELP3Q9H9T3 547 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 DOCK1Q14185 1865 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 RASSF9O75901 435 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 IL1R2P27930 398 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 UBR7Q8N806 425 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 SGK1O00141 431 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 HOXC6P09630 235 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 MAN1A1P33908 653 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 RFC5P40937 340 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 WDR49Q8IV35 697 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 LCTP09848 1927 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 OGTO15294 1046 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 ASAP2O43150 1006 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 GDF10P55107 478 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 METTL7BQ6UX53 244 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 FUKQ8N0W3 1084 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 SPOCK2Q92563 424 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 TWNKQ96RR1 684 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F6-211ENST00000542100 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 RASA4BC9J798 803 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ABLIM1O14639 778 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 RASA4O43374 803 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SNX3O60493 162 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ASPAP45381 313 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 RAB6CQ53S08 254 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 NEDD9Q14511 834 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 GPR20Q99678 358 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.02■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 TJP3O95049 919 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 PSMA2P25787 234 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ENPEPQ07075 957 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ZPBP2Q6X784 338 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SPATA33Q96N06 139 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SOCS7O14512 581 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 NFICP08651 508 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 GCAP28676 217 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 CROCCP2Q86T23 111 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 CPXM1Q96SM3 734 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SDCBP2Q9H190 292 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.01■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 UBOX5O94941 541 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 FOXN2P32314 431 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 STX2P32856 288 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 CDKN2BP42772 138 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ATF7IP2Q5U623 682 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 LRRN4Q8WUT4 740 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 PNMA3Q9UL41 463 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 CALB1P05937 261 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 EDNRBP24530 442 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 PLCB4Q15147 1175 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 ALLCQ8N6M5 410 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16■□□□□ 0.15
E2F6-211ENST00000542100 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms