RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 MMS19Q96T76 1030 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 CRISPLD1Q9H336 500 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.36■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 TMEM221A6NGB7 291 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 M0R296 226 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 GABRDO14764 452 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 MICAL2O94851 1124 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 CLSTN1O94985 981 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 PRCPP42785 496 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 VAMP7P51809 220 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 VEPH1Q14D04 833 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ITIH5Q86UX2 942 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 GDE1Q9NZC3 331 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 CEP72Q9P209 647 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.35■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 AKAP3O75969 853 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 FAM163BP0C2L3 166 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ZNF699Q32M78 642 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 WDR72Q3MJ13 1102 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 NPAS3Q8IXF0 933 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 DUSP12Q9UNI6 340 aa25.34■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 CETN3O15182 167 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 FGF19O95750 216 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 WARSP23381 471 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 EPHA5P54756 1037 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 MYL6P60660 151 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 HTR4Q13639 388 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 NCOA4Q13772 614 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ZACNQ401N2 412 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 OSTM1Q86WC4 334 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ING5Q8WYH8 240 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 SNX25Q9H3E2 840 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ABCB6Q9NP58 842 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 CDH9Q9ULB4 789 aa25.33■■□□□ 1.65
PITX1-206ENST00000507253 ANHXE9PGG2 379 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 PSMA7O14818 248 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TACC1O75410 805 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 P4HA1P13674 534 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 DLG4P78352 724 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 LRRC63Q05C16 580 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 ADSSL1Q8N142 457 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 PSMG2Q969U7 264 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SYT15Q9BQS2 421 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.32■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TECTAO75443 2155 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 MYL4P12829 197 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 CEBPBP17676 345 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 C4orf50Q6ZRC1 276 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TAF4BQ92750 862 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 NUMBLQ9Y6R0 609 aa25.31■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TAF12Q16514 161 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SV2AQ7L0J3 742 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 RSAD2Q8WXG1 361 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.3■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 STX10O60499 249 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SOAT2O75908 522 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 PIK3CAP42336 1068 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 TMC8Q8IU68 726 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 SLC44A3Q8N4M1 653 aa25.29■■□□□ 1.64
PITX1-206ENST00000507253 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms