RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 DDIT4Q9NX09 232 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GMNCA6NCL1 334 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 C2CD2LO14523 706 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 CST8O60676 142 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 EPHB2P29323 1055 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MTA1Q13330 715 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PGM5Q15124 567 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 COG4Q9H9E3 785 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 RBP3P10745 1247 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MTF1Q14872 753 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MRIQ9BWK5 157 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TRABDQ9H4I3 376 aa11.49□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PSTPIP1O43586 416 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 FDFT1P37268 417 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 IPPQ9Y573 584 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ALG6Q9Y672 507 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MCF2P10911 925 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 AXLP30530 894 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 AMPD2Q01433 879 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GIT2Q14161 759 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TAF6LQ9Y6J9 622 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 M0QYT0 321 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SUPT3HO75486 399 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TADA3O75528 432 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 EPHB3P54753 998 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ITIH5Q86UX2 942 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 COG1Q8WTW3 980 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 YY1AP1Q9H869 796 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 VTNP04004 478 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GEMP55040 296 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 IPMKQ8NFU5 416 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SCOCQ9UIL1 159 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ITM2BQ9Y287 266 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.48□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 YY1P25490 414 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PTGER2P43116 358 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 SERPINB4P48594 390 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PDK2Q15119 407 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PTPAQ15257 358 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 GRIK4Q16099 956 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 LCA5Q86VQ0 697 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ALDH2P05091 517 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 FGFR4P22455 802 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 PCSK7Q16549 785 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 RRM2BQ7LG56 351 aa11.47□□□□□ -0.57
TTLL3-232ENST00000496526 ADCK2Q7Z695 626 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms