RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TLR5O60602 858 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS23O95084 383 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 C8AP07357 584 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 FCER1AP12319 257 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ACVR2AP27037 513 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 CFPP27918 469 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 FSTL1Q12841 308 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 BIRC3Q13489 604 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ZACNQ401N2 412 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 MYCT1Q8N699 235 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 MED15Q96RN5 788 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 TRIB1Q96RU8 372 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 TLR10Q9BXR5 811 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.13□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 CAPN14A8MX76 684 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 PODXLO00592 558 aa9.12□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 A1BGP04217 495 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 TXKP42681 527 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF7Q14155 803 aa9.12□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.12□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 GGT6Q6P531 493 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ETAA1Q9NY74 926 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 VPS4BO75351 444 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 BMP7P18075 431 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 PAX3P23760 479 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 COPAP53621 1224 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 LAYNQ6UX15 382 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 RMDN3Q96TC7 470 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 MNTQ99583 582 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 GDF15Q99988 308 aa9.11□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RAD54BQ9Y620 910 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 DBX1A6NMT0 343 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 COMTP21964 271 aa9.1□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 RENBPP51606 427 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RABGGTBP53611 331 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 PFKFB4Q16877 469 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 UBXN11Q5T124 520 aa9.1□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.1□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.1□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 FAM234BA2RU67 622 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 E7ENX8 843 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 RAB27BO00194 218 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 METRNLQ641Q3 311 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 C1QL4Q86Z23 238 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRC-212ENST00000491302 POC1BQ8TC44 478 aa9.09□□□□□ -0.95
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