RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489437.1

RBM5-221, Transcript of RNA binding motif protein 5, human

TSL 3

Gene RBM5, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM5-221	ENST00000489437	B4GALT3	O60512	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	KIF4A	O95239	1232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CXCL14	O95715	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ITGB1	P05556	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TPM3	P06753	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ODC1	P11926	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	P4HA1	P13674	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	IGFBP4	P22692	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	LRPAP1	P30533	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ATIC	P31939	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ARPP19	P56211	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	UBASH3A	P57075	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ERVK-21	P61565	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CLDN10	P78369	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	UBXN1	Q04323	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ENPEP	Q07075	957 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	NCAPH	Q15003	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	KRT31	Q15323	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	NAB2	Q15742	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ZACN	Q401N2	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	MYH10	P35580	1976 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CDC14C	A4D256	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437		A8MXQ7	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437		H7C4K7	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GRM6	O15303	877 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	P4HA2	O15460	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	LRRN2	O75325	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	VNN1	O95497	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SOD2	P04179	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	UROD	P06132	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CD58	P19256	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SLC9A1	P19634	815 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	PAX3	P23760	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	KLRC2	P26717	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	USP8	P40818	1118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	GLUD2	P49448	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	CDH8	P55286	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	FANCC	Q00597	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	UBE3A	Q05086	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM5-221	ENST00000489437	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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