RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483281.5

RXRB-204, Transcript of retinoid X receptor beta, humanhuman

TSL 5

Gene RXRB, Length 1,977 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRB-204ENST00000483281 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 ACBD6Q9BR61 282 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 ARHGEF15O94989 841 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PAEPP09466 180 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 CTNNB1P35222 781 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 CBX1P83916 185 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 OSTM1Q86WC4 334 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.1■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 A8MXQ7 604 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 RAD23BP54727 409 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PANX2Q96RD6 677 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 NME7Q9Y5B8 376 aa22.09■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 H7C4K7 107 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 TBC1D4O60343 1298 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 KRT5P13647 590 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 LMO2P25791 158 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PCSK1P29120 753 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 DSG1Q02413 1049 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 TNIP3Q96KP6 325 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 CDH9Q9ULB4 789 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.08■■□□□ 1.13
RXRB-204ENST00000483281 PRKCIP41743 596 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 PTK2Q05397 1052 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 CYP26A1O43174 497 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 GFPT2O94808 682 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 USP8P40818 1118 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 RTP2Q5QGT7 225 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 CEP57Q86XR8 500 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 VPS52Q8N1B4 723 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 TWNKQ96RR1 684 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 CDK17Q00537 523 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 MEA1Q16626 185 aa22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 OR6C75A6NL08 312 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 H3BNC9 293 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 PDGFRBP09619 1106 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 CTSAP10619 480 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 DNAJB2P25686 324 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 GLUD2P49448 558 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ASIC2Q16515 512 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ZNF280DQ6N043 979 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 WDR59Q6PJI9 974 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ZBP1Q9H171 429 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.06■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 LILRB3O75022 631 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 VDRP11473 427 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 FECHP22830 423 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ZNF394Q53GI3 561 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 FAM171BQ6P995 826 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 ZNF677Q86XU0 584 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 MTRRQ9UBK8 725 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 IRAK3Q9Y616 596 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 SERPING1P05155 500 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 HGSNATQ68CP4 663 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 B3GALT6Q96L58 329 aa22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
RXRB-204ENST00000483281 FNIP2Q9P278 1114 aa22.05■■□□□ 1.12
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