RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TRABDQ9H4I3 376 aa16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 CISHQ9NSE2 258 aa16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 F8VP50 259 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 OGTO15294 1046 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 NF2P35240 595 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 STAT5BP51692 787 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 RASA2Q15283 850 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB33Q86T24 672 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 FAM228AQ86W67 206 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TTC13Q8NBP0 860 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 FBF1Q8TES7 1133 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 LCTP09848 1927 aa16.19■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ALOX15BO15296 676 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 KRT7P08729 469 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TAC1P20366 129 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PHBP35232 272 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 CDKN2BP42772 138 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MYL6P60660 151 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ADCY1Q08828 1119 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SETDB1Q15047 1291 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SEZ6Q53EL9 994 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 IER5Q5VY09 327 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 GGT7Q9UJ14 662 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MAGEB2O15479 319 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MED7O43513 233 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TNNC2P02585 160 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 EDN1P05305 212 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TCF4P15884 667 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF699Q32M78 642 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ATP5HO75947 161 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ASMTLO95671 621 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 IFNB1P01574 187 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PSMA2P25787 234 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TNFSF9P41273 254 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PDE4CQ08493 712 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MAPK6Q16659 721 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 HIF1AQ16665 826 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 MCM8Q9UJA3 840 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SMAPO00193 183 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 SPAG7O75391 227 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 PRKCBP05771 671 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ETS1P14921 441 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ALDH3A1P30838 453 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 ARL4CP56559 192 aa16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
C9orf3-218ENST00000482056 OGDHQ02218 1023 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms