RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	VSTM4	Q8IW00	320 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	UBR7	Q8N806	425 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	WHAMM	Q8TF30	809 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MTRR	Q9UBK8	725 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	STK39	Q9UEW8	545 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		14	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153		H7C4K7	107 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	FSCN2	O14926	492 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	LILRB3	O75022	631 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CILP	O75339	1184 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	OR1D2	P34982	312 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PTPRD	P23468	1912 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PER2	O15055	1255 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TEX28	O15482	410 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CPB1	P15086	417 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SHC3	Q92529	594 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CEP72	Q9P209	647 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	RFX1	P22670	979 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PCSK1	P29120	753 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	RAD23B	P54727	409 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TSPY1	Q01534	308 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153		F8VZ95	297 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP26A1	O43174	497 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	GYPC	P04921	128 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	IGFBP4	P22692	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	KLRC2	P26717	231 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	JAM2	P57087	298 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ROR1	Q01973	937 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SUMO3-206	ENST00000479153	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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