RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 TNNC1P63316 161 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 TWF1Q12792 350 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 DUSP4Q13115 394 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 BIRC3Q13489 604 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 VEPH1Q14D04 833 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 MMS19Q96T76 1030 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ASAH2Q9NR71 780 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 L1RE1Q9UN81 338 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 EPHA5P54756 1037 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 TDGQ13569 410 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZACNQ401N2 412 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ADSSL1Q8N142 457 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZNF516Q92618 1163 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FGF13Q92913 245 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 PRRX2Q99811 253 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 KCNK12Q9HB15 430 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CDH9Q9ULB4 789 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 YIPF1Q9Y548 306 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 BICDL2A1A5D9 508 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 AKAP3O75969 853 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 OR4Q2P0C623 313 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CASP4P49662 377 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 MRE11P49959 708 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 NCOA4Q13772 614 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZNF699Q32M78 642 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 PSMG2Q969U7 264 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 GBP4Q96PP9 640 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CORO1BQ9BR76 489 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SNX25Q9H3E2 840 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 ANHXE9PGG2 379 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CCNE1P24864 410 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 MYL6P60660 151 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 TAF12Q16514 161 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SV2AQ7L0J3 742 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 FBXL6Q8N531 539 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 E2F7Q96AV8 911 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 MYADMQ96S97 322 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 NOTCH4Q99466 2003 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 EHD2Q9NZN4 543 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 CEP72Q9P209 647 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.27□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.27□□□□□ -0.12
PRAME-211ENST00000476336 SOBPA7XYQ1 873 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 CLSTN1O94985 981 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 VNN2O95498 520 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 MAGEA11P43364 429 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 KRT39Q6A163 491 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-211ENST00000476336 FAM171BQ6P995 826 aa14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms