RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471635.5

RBM39-228, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-228	ENST00000471635	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635		M0QYG6	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	DTNB	O60941	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	ARIH2	O95376	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	PDC	P20941	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	CD6	P30203	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	CCT8	P50990	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	NOG	Q13253	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	KIF22	Q14807	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	GPR162	Q16538	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	AOX1	Q06278	1338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-228	ENST00000471635	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SOAT2	O75908	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	AHSG	P02765	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	GNAI2	P04899	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PRKCG	P05129	697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	DRD4	P21917	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TBCC	Q15814	346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	USP37	Q86T82	979 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SLC16A6	O15403	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PDHA1	P08559	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF81	P51508	661 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	HK3	P52790	923 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PPM1D	O15297	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	IL33	O95760	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	NDUFB7	P17568	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	MAP2K6	P52564	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	USP45	Q70EL2	814 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	NXPH3	O95157	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	CELA2A	P08217	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TYR	P14679	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	JUP	P14923	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	PCSK6	P29122	969 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TFF2	Q03403	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	TCF15	Q12870	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	GRM1	Q13255	1194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-228	ENST00000471635	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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