RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 RGL1Q9NZL6 768 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 HESX1Q9UBX0 185 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.531e-323■□□□□ 8.2
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 INHBBP09529 407 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 FDXRP22570 491 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINF1P36955 418 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 EPHB4P54760 987 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2CBP62714 309 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2CAP67775 309 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC29A2Q14542 456 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 CSRP2Q16527 193 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 VMACQ2NL98 169 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 RFX8Q6ZV50 586 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX19Q8NA77 164 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX27Q96L92 541 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 SPON1Q9HCB6 807 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 PNMA2Q9UL42 364 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A087WZ62 844 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 AQP12BA6NM10 295 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 DRGXA6NNA5 263 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNQ3O43525 872 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ITGA5P08648 1049 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNC1P48547 511 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 CPT1AP50416 773 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ITGA8P53708 1063 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 PIGFQ07326 219 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 SLFN5Q08AF3 891 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF7Q14155 803 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 GRM7Q14831 915 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 INSCQ1MX18 579 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 MED25Q71SY5 747 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT73Q86Y46 540 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 TBATAQ96M53 351 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 MESP1Q9BRJ9 268 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.534e-6■■□□□ 14
RABGGTB-207ENST00000470201 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 ETAA1Q9NY74 926 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 POGKQ9P215 609 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB27BO00194 218 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM38O00635 465 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 IRAK2O43187 625 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 NUAK1O60285 661 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 MFAP3LO75121 409 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 CKBP12277 381 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 FCER1AP12319 257 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 EGR1P18146 543 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 GCSHP23434 173 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPK9P45984 424 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 CHN2P52757 468 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL4CP56559 192 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 POSTNQ15063 836 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 SLFN13Q68D06 897 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 SMOQ99835 787 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 TLR10Q9BXR5 811 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 RRN3Q9NYV6 651 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-207ENST00000470201 CDYLQ9Y232 598 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms