RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ACCSQ96QU6 501 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 FNBP1Q96RU3 617 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 THTPAQ9BU02 230 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 EBF3Q9H4W6 596 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SENP1Q9P0U3 644 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 STK24Q9Y6E0 443 aa18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MYPNQ86TC9 1320 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ALOX15BO15296 676 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 P4HA2O15460 535 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 KITP10721 976 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SCNN1BP51168 640 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 PEX3P56589 373 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 FAM210AQ96ND0 272 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 KRT39Q6A163 491 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 CCDC174Q6PII3 467 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RAPH1Q70E73 1250 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ECSITQ9BQ95 431 aa18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DENND3A2RUS2 1198 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SGK1O00141 431 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 JAG1P78504 1218 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DCAF4Q8WV16 495 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MECRQ9BV79 373 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RAB20Q9NX57 234 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 HLA-DOAP06340 250 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 NSFP46459 744 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 NRLP54845 237 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DYNLT1P63172 113 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SPDYAQ5MJ70 313 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SPOPLQ6IQ16 392 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 CENPUQ71F23 418 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 BANPQ8N9N5 519 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SERAC1Q96JX3 654 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MEI4A8MW99 385 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 OR6B1O95007 311 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DSG1Q02413 1049 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 CDC16Q13042 620 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 LIN52Q52LA3 116 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 EFHC2Q5JST6 749 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 PYROXD1Q8WU10 500 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 LPXNO60711 386 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SV2AQ7L0J3 742 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ZNF398Q8TD17 642 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 TMEM206Q9H813 350 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 GRIA2P42262 883 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 ALLCQ8N6M5 410 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 FBXL13Q8NEE6 735 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MZB1Q8WU39 189 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 FAM192AQ9GZU8 254 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 PREBQ9HCU5 417 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SLC24A2Q9UI40 661 aa18.74■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 OPHN1O60890 802 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 INHBCP55103 352 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MAMLD1Q13495 774 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 HIF1AQ16665 826 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 CCDC142Q17RM4 750 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 DOK7Q18PE1 504 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 GINM1Q9NU53 330 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 GDF10P55107 478 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SOX10P56693 466 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 BBS9Q3SYG4 887 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SCUBE1Q8IWY4 988 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 FBXO36Q8NEA4 188 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 PYDC1Q8WXC3 89 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 OPTNQ96CV9 577 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 SLC7A8Q9UHI5 535 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa18.73■□□□□ 0.59
PREB-208ENST00000468045 KRT1P04264 644 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms