RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	AFM	P43652	599 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CXCL12	P48061	93 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	DPYD	Q12882	1025 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP68	Q76N32	757 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ELMOD1	Q8N336	334 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ITFG1	Q8TB96	612 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM3C	Q92520	227 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MTRR	Q9UBK8	725 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MAFF	Q9ULX9	164 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PIR	O00625	290 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PRRG1	O14668	218 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RHO	P08100	348 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPN2	P17706	415 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ACOT2	P49753	483 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RAB33A	Q14088	237 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NFIL3	Q16649	462 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245		H7C4K7	107 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	MAPK13	O15264	365 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	OAZ2	O95190	189 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TYMP	P19971	482 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CASP1	P29466	404 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	OR1D2	P34982	312 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PNPLA4	P41247	253 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ENPEP	Q07075	957 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	STK4	Q13043	487 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LONP2	Q86WA8	852 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HPS3	Q969F9	1004 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF263	O14978	683 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP11A1	P05108	521 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	NFIC	P08651	508 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMC3	P17980	439 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	GDI1	P31150	447 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-223	ENST00000466245	LIMK1	P53667	647 aa		10.84	□□□□□ -0.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms