RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 SENP8Q96LD8 212 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 CCL26Q9Y258 94 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 LAMA1P25391 3075 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 LNP1A1A4G5 178 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 LACTBL1A8MY62 500 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ARSAP15289 507 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 GBP1P32455 592 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SMTNP53814 917 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ANAPC15P60006 121 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 PDIA5Q14554 519 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KRT79Q5XKE5 535 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TIPINQ9BVW5 301 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 NUP205Q92621 2012 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 APBB3O95704 486 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 PLS3P13797 630 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 DRD1P21728 446 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.628e-8■□□□□ 11.2
PTPRA-208ENST00000455631 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 LILRA4P59901 499 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KCNK18Q7Z418 384 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 OBSL1O75147 1896 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 GUCY2CP25092 1073 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 GALK1P51570 392 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ST3GAL1Q11201 340 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO43Q4G163 708 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KCNG1Q9UIX4 513 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 WASF3Q9UPY6 502 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 CDC25AP30304 524 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TRAPPC10P48553 1259 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 DMC1Q14565 340 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SYT13Q7L8C5 426 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 EXOC4Q96A65 974 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 FAM212AQ96EL1 285 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TDP1Q9NUW8 608 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM8BA6NDV4 472 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 LIG4P49917 911 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 PSMD2Q13200 908 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ACAP1Q15027 740 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SPATA1Q5VX52 437 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 RIN3Q8TB24 985 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ACDQ96AP0 544 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM9BQ9NQ34 198 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 EBF1Q9UH73 591 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 INVSQ9Y283 1065 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRA-208ENST00000455631 SPEGQ15772 3267 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 GJA4P35212 333 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 DGKEP52429 567 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 NLRP12P59046 1061 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 PDGFRLQ15198 375 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 KYAT1Q16773 422 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 TXNDC8Q6A555 127 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 JADE1Q6IE81 842 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 ASPMQ8IZT6 3477 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 TCHHQ07283 1943 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 CYP11A1P05108 521 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 CEACAM1P13688 526 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 METTL23Q86XA0 190 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 CPA6Q8N4T0 437 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 TTC16Q8NEE8 873 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 SCNM1Q9BWG6 230 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 DSEQ9UL01 958 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 TBX20Q9UMR3 447 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRA-208ENST00000455631 IGF2RP11717 2491 aa25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms