RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 HCRTO43612 131 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TADA3O75528 432 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXD13P35453 343 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR15P49685 360 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPHB3P54753 998 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLD1Q13393 1074 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 E2F4Q16254 413 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSTM1Q86WC4 334 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM3CQ92520 227 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 RUBCNQ92622 972 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAAL1Q96ER3 474 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR88Q9GZN0 384 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPC1Q9H2F5 836 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 L1RE1Q9UN81 338 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB3Q9Y575 518 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNA1BQ00975 2339 aa9.13□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KPNA7A9QM74 516 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAN2B1O00754 1011 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF263O14978 683 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KINO60870 393 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 F11P03951 625 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGB3P05106 788 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAP43P17677 238 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAX3P23760 479 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCNE1P24864 410 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 WEE1P30291 646 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTHP32929 405 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCD1P33897 745 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALDH1A3P47895 512 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NASPP49321 788 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SATB1Q01826 763 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNK2Q07912 1038 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 DMWDQ09019 674 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC39A14Q15043 492 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR158Q5T848 1215 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZS52 159 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIPC2Q8TF65 315 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPS3Q969F9 1004 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARD6AQ9NPB6 346 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIX4Q9UIU6 781 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NME7Q9Y5B8 376 aa9.12□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CKAP5Q14008 2032 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7ESF4 209 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCAM2O15394 837 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL18RAPO95256 599 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCNT3O95395 438 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDCP20941 246 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 GARTP22102 1010 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRP12P59046 1061 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCINQ13939 588 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SV2CQ496J9 727 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 SV2BQ7L1I2 683 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.11□□□□□ -0.95
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms