RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447577.5

CCDC18-AS1-216, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 431 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PLXNA2O75051 1894 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TSPAN1O60635 241 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GABRR2P28476 465 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 OXCT1P55809 520 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SKOR1P84550 965 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AMPD2Q01433 879 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TRAF1Q13077 416 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CLCA4Q14CN2 919 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KIF19Q2TAC6 998 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MTERF2Q49AM1 385 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CEP55Q53EZ4 464 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ESR2Q92731 530 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MIB2Q96AX9 1013 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MOCOSQ96EN8 888 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NUMA1Q14980 2115 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MEI4A8MW99 385 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 H0Y8X5 98 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MEIS1O00470 390 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PCDHGA12O60330 932 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SOAT2O75908 522 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RLBP1P12271 317 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WEE1P30291 646 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CLN3Q13286 438 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IL27RAQ6UWB1 636 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IQCA1Q86XH1 822 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GATAD2AQ86YP4 633 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CPA6Q8N4T0 437 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TASP1Q9H6P5 420 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 IL21Q9HBE4 155 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 MRS2Q9HD23 443 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PARP2Q9UGN5 583 aa7□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 B3GAT3O94766 335 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NPTXRO95502 500 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C8BP07358 591 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PSAPP07602 524 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CCT8P50990 548 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CDR1P51861 262 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PDGFRLQ15198 375 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TPGS2Q68CL5 300 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 NOTUMQ6P988 496 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 XKR5Q6UX68 686 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 RFFLQ8WZ73 363 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 DKK3Q9UBP4 350 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 FAM86B1E9PN63 330 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC18-AS1-216ENST00000447577 B4GALT5O43286 388 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms