RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ATP2B1P20020 1258 aa7.2□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 TRIP11Q15643 1979 aa7.2□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 DEPTORQ8TB45 409 aa7.19□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.19□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.19□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 OSTNP61366 133 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 MTAPQ13126 283 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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HOXD8-202ENST00000429017 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.18□□□□□ -1.26
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