RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CSRP2Q16527 193 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 KSR2Q6VAB6 950 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 LCORLQ8N3X6 602 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 COQ10AQ96MF6 247 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 SZT2Q5T011 3432 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 CRHR1P34998 444 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC142Q17RM4 750 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 BEND3Q5T5X7 828 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.76□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 TFAP2CQ92754 450 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 STK31Q9BXU1 1019 aa6.76□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 SYBUQ9NX95 663 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 UTYO14607 1347 aa6.76□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 COL15A1P39059 1388 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CAMTA2O94983 1202 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 IGKV5-2P06315 115 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 EPHX2P34913 555 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 LGALS4P56470 323 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 BLOC1S1P78537 153 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 GUCY1B3Q02153 619 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 GRM1Q13255 1194 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CST9Q5W186 159 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 ZNF185O15231 689 aa6.74□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.74□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 TEX101Q9BY14 249 aa6.74□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 COL6A3P12111 3177 aa6.74□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 RPTORQ8N122 1335 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CEP290O15078 2479 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PIPSLA2A3N6 862 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 H0YIN7 160 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PJA2O43164 708 aa6.73□□□□□ -1.33
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C9orf3-205ENST00000427193 CT83Q5H943 113 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 RNF169Q8NCN4 708 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 LINS1Q8NG48 757 aa6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-205ENST00000427193 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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