RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426925.5

SH3BP5-206, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

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Gene SH3BP5, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-206ENST00000426925 USP4Q13107 963 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 RCOR2Q8IZ40 523 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 MZB1Q8WU39 189 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 NT5C1BQ96P26 610 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 PANX3Q96QZ0 392 aa17.63■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 LPXNO60711 386 aa17.63■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 LIN9Q5TKA1 542 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 KRT39Q6A163 491 aa17.63■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 WWP1Q9H0M0 922 aa17.62■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 PFDN1O60925 122 aa17.62■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC17Q96LX7 622 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 C7orf26Q96N11 449 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 CATSPER2Q96P56 530 aa17.62■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 EBF3Q9H4W6 596 aa17.62■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 HSPBP1Q9NZL4 362 aa17.62■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 DHDDSQ86SQ9 333 aa17.61■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.61■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 I3L4J1 428 aa17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 ACP6Q9NPH0 428 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 MYH11P35749 1972 aa17.6■□□□□ 0.41
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SH3BP5-206ENST00000426925 PEX1O43933 1283 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 RAD21O60216 631 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 ITGAVP06756 1048 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 NSFP46459 744 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 ATG16L1Q676U5 607 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 DCAKDQ8WVC6 231 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP5-206ENST00000426925 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
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