RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AMBPP02760 352 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOXC6P09630 235 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CTSAP10619 480 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRK2P25098 689 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRK3P35626 688 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBMXP38159 391 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD16Q6P6B7 361 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABHD17CQ6PCB6 329 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GK5Q6ZS86 529 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRTM1Q86UE6 522 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ENGASEQ8NFI3 743 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH3RF2Q8TEC5 729 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIC2Q96JB3 615 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALG8Q9BVK2 526 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBCK1Q9BYM8 510 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANO3Q9BYT9 981 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYO6Q9UM54 1294 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRPK3Q9UPE1 567 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCF19Q9Y242 345 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DTX4Q9Y2E6 619 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP23Q9Y6H3 246 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AATKQ6ZMQ8 1374 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TGP01266 2768 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATG7O95352 703 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GJB6O95452 261 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A1BGP04217 495 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ECHS1P30084 290 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLD2P49005 469 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APBA1Q02410 837 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLCQ05315 142 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DUSP2Q05923 314 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITIH3Q06033 890 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ST3GAL1Q11201 340 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SHHQ15465 462 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM72Q6ZMU5 477 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MED25Q71SY5 747 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM29Q86T20 159 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GLYCTKQ8IVS8 523 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGFBP3Q8TAT2 258 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RFKQ969G6 155 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RUNDC1Q96C34 613 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNJ15Q99712 375 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EFHD1Q9BUP0 239 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM15Q9C019 465 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KANSL2Q9H9L4 492 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HIF1ANQ9NWT6 349 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLK2Q9NYY3 685 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCMF1Q9P0J7 381 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USP25Q9UHP3 1055 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC6A5Q9Y345 797 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASB1Q9Y576 335 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAT1Q14517 4588 aa-0.49□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AKAP13Q12802 2813 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0J9YWU9 116 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC78A2IDD5 438 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLEC18AA5D8T8 446 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF814B7Z6K7 855 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM72CH0Y354 149 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBE2Q2LH0YL09 131 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H3BRB1 525 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H7C1Q1 480 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOP56O00567 594 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FSBPO95073 299 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CPP00450 1065 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCG5P05408 212 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MMEP08473 750 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WEE2P0C1S8 567 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALAS1P13196 640 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GCSHP23434 173 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOXC12P31275 282 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ECI1P42126 302 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DRG2P55039 364 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM160A1Q05DH4 1040 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FIGNQ5HY92 759 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM72AQ5TYM5 149 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALG1LQ6GMV1 187 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANO7Q6IWH7 933 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM72DQ6L9T8 149 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q6ZR54 194 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAVSQ7Z434 540 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM72BQ86X60 149 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms