RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MIER1Q8N108 512 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRN4CLQ8ND94 238 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF248Q8NDW4 579 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANGPTL6Q8NI99 470 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHDC7BQ96G42 594 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIC2Q96JB3 615 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMM17AQ99595 171 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLA2G12BQ9BX93 195 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INPP5EQ9NRR6 644 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEPPQ9NTK1 212 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA1456Q9P272 454 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP10Q9P2G4 905 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCD2Q9UBJ2 740 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO40Q9UH90 709 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F6X3S4 739 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H0YJW9 148 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT7AO00755 349 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC01565O15544 149 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PJA2O43164 708 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLOD3O60568 738 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD3DP04234 171 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B4GALT1P15291 398 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCP2P22307 547 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CA6P23280 308 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITPKBP27987 946 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOX11P35716 441 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BCAMP50895 628 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBED6P86452 979 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPAG11BQ08648 103 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRB10Q13322 594 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HERC3Q15034 1050 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZSCAN26Q16670 478 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF151Q2KHN1 245 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEFB115Q30KQ5 88 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INAVAQ3KP66 663 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NADK2Q4G0N4 442 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C9orf50Q5SZB4 431 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJC24Q6P3W2 148 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP17L2Q6R6M4 530 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAQR6Q6TCH4 344 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STAC2Q6ZMT1 411 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RFLNAQ6ZTI6 216 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AACSQ86V21 672 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKLE2Q86XL3 938 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PALB2Q86YC2 1186 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VRK3Q8IV63 474 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCML4Q8N228 414 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEPDC4Q8N2C3 294 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA0895Q8NCT3 520 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OLIG1Q8TAK6 271 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAM32Q8TC27 787 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF384Q8TF68 577 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FCRL4Q96PJ5 515 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GABRG3Q99928 467 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM83CQ9BQN1 747 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM39BQ9GZU3 492 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNTTIP1Q9H147 329 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL1RAPQ9NPH3 570 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RLIMQ9NVW2 624 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU2F3Q9UKI9 436 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHA12Q9UN75 941 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCN1AP35498 2009 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MGAMO43451 1857 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADGRB1O14514 1584 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLIT1O75093 1534 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GUS0 222 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM90A10PA6NDY2 464 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM90A18PA6NE21 464 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM90A16PA6NEW6 464 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC22A31A6NKX4 558 aa-3.12□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms