RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PRR29P0C7W0 189 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 NQO1P15559 274 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PSMC3P17980 439 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PNPLA4P41247 253 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SNAP25P60880 206 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 FAM189A2Q15884 450 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM16LQ309B1 348 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ZCWPW2Q504Y3 356 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 DACH2Q96NX9 599 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 FAR1Q8WVX9 515 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 HSPH1Q92598 858 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 RAD54LQ92698 747 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 MST1RQ04912 1400 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 SNX2O60749 519 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 TXKP42681 527 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 DGUOKQ16854 277 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.12□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 THEM5Q8N1Q8 247 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ANXA6P08133 673 aa5.12□□□□□ -1.59
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