RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 TIMM44O43615 452 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CYP11B1P15538 503 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CHRNB2P17787 502 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NAB2Q15742 525 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ADAM2Q99965 735 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MRGBPQ9NV56 204 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NAGPAQ9UK23 515 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PJA2O43164 708 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CYP3A5P20815 502 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TMEM270Q6UE05 265 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LPPQ93052 612 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CD248Q9HCU0 757 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ACP6Q9NPH0 428 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RGS18Q9NS28 235 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ATP8B3O60423 1300 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CEP350Q5VT06 3117 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KRT86O43790 486 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZNF623O75123 536 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CALCAP01258 141 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PYGLP06737 847 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MMEP08473 750 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 WEE2P0C1S8 567 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 COL6A1P12109 1028 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SKIP12755 728 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 P4HA1P13674 534 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CD58P19256 250 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RAP1GAPP47736 663 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZNF132P52740 706 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 BPIFB4P59827 614 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CDR2Q01850 454 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 KIF5AQ12840 1032 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MYO1EQ12965 1108 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 USP4Q13107 963 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 WHAMMQ8TF30 809 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 FAM117AQ9C073 453 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 CISHQ9NSE2 258 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.44□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 A0A0U1RQF3 1178 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ANO9A1A5B4 782 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ARL5CA6NH57 179 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PITPNM1O00562 1244 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PTGESO14684 152 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PPEF2O14830 753 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 MLH1P40692 756 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 FMO1Q01740 532 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZNF677Q86XU0 584 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SDCBP2Q9H190 292 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PIRO00625 290 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 NBNO60934 754 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 GNG11P61952 73 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TNNC1P63316 161 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 TRIM60Q495X7 471 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 PGBD4Q96DM1 585 aa6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCR6-201ENST00000341935 ZFP42Q96MM3 310 aa6.43□□□□□ -1.38
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