RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264839.11

RIMS1-201, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RIMS1, Length 7,055 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-201ENST00000264839 EPHB2P29323 1055 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 MAP3K10Q02779 954 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TRIM69Q86WT6 500 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DGKHQ86XP1 1220 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TPCN2Q8NHX9 752 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 PSD3Q9NYI0 1048 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 PTCH1Q13635 1447 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 OPLAHO14841 1288 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DEFA1P59665 94 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DEFA3P59666 94 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 GCNAQ96QF7 691 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 AKT1P31749 480 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CDHR1Q96JP9 859 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM165Q9HC07 324 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SLAIN2Q9P270 581 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ERVK-7P63135 1459 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CPDO75976 1380 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 F5H6K3 240 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 FGFR2P21802 821 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 KLRC3Q07444 240 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 RASA2Q15283 850 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DCAF6Q58WW2 860 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SLC7A14Q8TBB6 771 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ARHGEF37A1IGU5 675 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 NDUFS3O75489 264 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ENDOD1O94919 500 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 KCNK10P57789 538 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 KLHL4Q9C0H6 718 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 NFIL3Q16649 462 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SYTL1Q8IYJ3 562 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 STX19Q8N4C7 294 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 FBXO36Q8NEA4 188 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CHKBQ9Y259 395 aa13.16□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 PMPCBO75439 489 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CBX6O95503 412 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CAPN1P07384 714 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CCNA1P78396 465 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 NCOA4Q13772 614 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 UBP1Q9NZI7 540 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SEPT3Q9UH03 358 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 A0A087X0T9 212 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 GUCA1CO95843 209 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 FAM228BP0C875 321 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CPB1P15086 417 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 LUZP2Q86TE4 346 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 IQCA1LA6NCM1 817 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 PHKA2P46019 1235 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 MAGED4Q96JG8 741 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CHST12Q9NRB3 414 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 H7C1W4 665 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 CHRM3P20309 590 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DCAF4Q8WV16 495 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 ANKS1AQ92625 1134 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 MARK4Q96L34 752 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TBX22Q9Y458 520 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TRIM43BA6NCK2 446 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 RAB14P61106 215 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TRAF2Q12933 501 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 AP3B2Q13367 1082 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SCARA3Q6AZY7 606 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.15□□□□□ -0.3
RIMS1-201ENST00000264839 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms