RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC66A2RUB6 948 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC188H7C350 402 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PIRO00625 290 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR182O15218 404 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TLR3O15455 904 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP104O60308 925 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS6KA5O75582 802 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TRPA1O75762 1119 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CALCAP01258 141 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CFHP08603 1231 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 VDRP11473 427 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ELNP15502 786 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 COMTP21964 271 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RRM1P23921 792 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PNPLA4P41247 253 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PEX5P50542 639 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TNNC1P63316 161 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TAP1Q03518 808 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf54Q08AI8 447 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PTK7Q13308 1070 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 STILQ15468 1287 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CNGA2Q16280 664 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP2R5EQ16537 467 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 LIMS2Q7Z4I7 341 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 UNC93AQ86WB7 457 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 HACE1Q8IYU2 909 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC4A11Q8NBS3 891 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RAET1EQ8TD07 263 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TFAP2BQ92481 460 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 MS4A14Q96JA4 679 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PNKPQ96T60 521 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ZSWIM1Q9BR11 485 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 EPC1Q9H2F5 836 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SMYD3Q9H7B4 428 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PARVAQ9NVD7 372 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 STRIP2Q9ULQ0 834 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 IPPQ9Y573 584 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO1FO00160 1098 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 FKTNO75072 461 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF623O75123 536 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ERLIN1O75477 346 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PROSCO94903 275 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CHRNA1P02708 482 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOXF2BP0C7M4 288 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPA6P17066 643 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 LRPAP1P30533 357 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 GUCY2FP51841 1108 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CDH8P55286 799 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 MAMLD1Q13495 774 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 MESDQ14696 234 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM47CQ5HY64 1035 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 C9orf57Q5W0N0 161 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 PASD1Q8IV76 773 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 WDTC1Q8N5D0 677 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 WNT8BQ93098 351 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF560Q96MR9 790 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 GDAP2Q9NXN4 497 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR35Q9P2L0 1181 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 HES2Q9Y543 173 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 O00370 1275 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 SPOPO43791 374 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 CD19P15391 556 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 AKAP5P24588 427 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFRSF8P28908 595 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RAP1GAPP47736 663 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 VEGFBP49765 207 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB27AP51159 221 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 DNA2P51530 1060 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 VSNL1P62760 191 aa10.11□□□□□ -0.79
APOBEC1-201ENST00000229304 ITGA7Q13683 1181 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms