RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhpn2Q8BWR8 686 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf2Q8C176 1104 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasal3Q8C2K5 1041 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata32Q8C5V0 334 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oas1gQ8K469 367 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BbxQ8VBW5 907 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc5Q8VDZ4 715 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc7Q91WU6 308 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chst12Q99LL3 419 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Haus2Q9CQS9 234 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ribc1Q9D0B8 379 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phospho2Q9D9M5 241 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl1Q9Z120 268 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex11aQ9Z211 246 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sept5Q9Z2Q6 369 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elf4Q9Z2U4 655 aa12.02□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hes2O54792 157 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itgb3O54890 787 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AladP10518 330 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Irf8P23611 424 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif2b4Q61749 524 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec16aQ80U30 1036 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem108Q8BHE4 574 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgif2Q8C0Y1 237 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slfn5Q8CBA2 884 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdha2Q91Y17 948 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cst12Q9DAN8 128 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RlfA2A7F4 1918 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf3c1Q8K284 2101 aa12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FryE9Q8I9 3020 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpm6Q8CIR4 2028 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11758A2BEI6 360 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm11757A2BEI8 360 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r79E9Q067 851 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10721J3QPJ9 223 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim43cP86449 446 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk7Q03147 346 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpne7Q0VE82 557 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NfkbidQ2TB02 327 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spire1Q52KF3 598 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adora2aQ60613 410 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sim2Q61079 657 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxj1Q61660 421 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ManeaQ6NXH2 462 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aggf1Q7TN31 711 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1105Q7TR58 312 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Strip2Q8C9H6 844 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igsf8Q8R366 611 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc5a9Q8VDT1 685 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CarfQ8VHI4 689 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oxct2bQ9ESL0 520 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Timp4Q9JHB3 224 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oxct2aQ9JJN4 520 aa12□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp8b5A3FIN4 1183 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5483B2RV77 97 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10110D3Z5M2 615 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a10E9PXN7 530 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Calhm3J3QMI4 347 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh7O88451 316 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrm1P12657 460 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shmt1P50431 478 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abi2P62484 446 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a2P70691 533 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a9Q62452 528 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a1Q63886 535 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a6Q64435 531 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adat2Q6P6J0 191 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Leg1Q8C6C9 337 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem132aQ922P8 1018 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtfr1Q99MB2 328 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp29Q9ES63 869 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prmt2Q9R144 448 aa11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnot1Q6ZQ08 2375 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtl9Q32KG4 1339 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc27A2A6Q5 825 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1023A2ASU6 311 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp384E9Q1A5 584 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zscan29E9Q5B4 869 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam19O35674 920 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd160O88875 185 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AfmO89020 608 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AlbP07724 608 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myl4P09541 193 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SrgnP13609 152 aa11.98□□□□□ -0.49
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif3aP28741 701 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms