RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019722.11

Ubxn6-201, Transcript of UBX domain-containing protein 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn6, Length 2,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccdc13D3YV10 709 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lipo2D3YY49 398 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cd70O55237 195 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CidebO70303 219 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 PklrP53657 574 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rasgrf2P70392 1189 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 VcpQ01853 806 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gbp8Q2V6D6 525 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gsdmc4Q3TR54 480 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Slc9b2Q5BKR2 547 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 N4bp1Q6A037 893 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rtp1Q8C8C1 263 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Snx30Q8CE50 437 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Trim66Q924W6 1242 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ankef1Q9D2J7 775 aa11.68□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Anxa8O35640 327 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rtn2O70622 471 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dynlt1P51807 113 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pms2P54279 859 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Znf112Q0VAW7 879 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mylk3Q3UIZ8 795 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm8773Q3UQ24 132 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Capn13Q3UW68 665 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Stxbp2Q64324 593 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ripor1Q68FE6 1223 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Nsun6Q7TS68 476 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Anapc5Q8BTZ4 740 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Rbbp5Q8BX09 538 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ttc39bQ8BYY4 617 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Usp37Q8C0R0 979 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Znf276Q8CE64 614 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 OafQ8QZR4 282 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Q8R1Y2 203 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Polr3fQ921X6 316 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cetn2Q9R1K9 172 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm11549A0A286YD83 63 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tubb1A2AQ07 451 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Klhl41A2AUC9 606 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm10436L7N1Y3 520 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp42P22227 288 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 DselQ0VBN2 1207 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pdlim7Q3TJD7 457 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pik3r5Q5SW28 871 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dpysl3Q62188 570 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Atp4aQ64436 1033 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gpatch2lQ6PE65 482 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AmphQ7TQF7 686 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ccnt2Q7TQK0 723 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Impg2Q80XH2 1243 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Kcns3Q8BQZ8 491 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pak4Q8BTW9 593 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Trip10Q8CJ53 603 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Haus3Q8QZX2 570 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tmem206Q9D771 350 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Sapcd2Q9D818 391 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dusp21Q9D9D8 189 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Aldh18a1Q9Z110 795 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa11.67□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zfp105G3X9I0 524 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ifnar2O35664 513 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Impa1O55023 277 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Slc10a3P21129 473 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Mcpt4P21812 246 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 RarbP22605 482 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 CtshP49935 333 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Esyt3Q5DTI8 891 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Taf5Q8C092 801 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Pcdha2Q91Y17 948 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Diaph3Q9Z207 1171 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Fem1bQ9Z2G0 627 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zscan4dA7KBS4 506 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Adgrf2E9Q4J9 644 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gm3460E9QAI8 215 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Tspyl1O88852 379 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Apba3O88888 571 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 AmhP27106 555 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Usp10P52479 792 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Lzts1P60853 599 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Npas2P97460 816 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Jdp2P97875 163 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Srebf2Q3U1N2 1130 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Gxylt1Q3UHH8 404 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zscan4fQ3URS2 506 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Ampd1Q3V1D3 745 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Wdr18Q4VBE8 431 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Soat1Q61263 540 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Hmgb4Q6P8W9 181 aa11.66□□□□□ -0.54
Ubxn6-201ENSMUST00000019722 Zscan4cQ80VJ6 506 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms