RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF132	P52740	706 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	COPS5	Q92905	334 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GGA2	Q9UJY4	613 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LRRD1	A4D1F6	860 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	OGT	O15294	1046 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IFNB1	P01574	187 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CETP	P11597	493 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19	6e-6	■■■■□ 19.9
BRF1-222	ENST00000635152	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GGT7	Q9UJ14	662 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GH1	P01241	217 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CETN2	P41208	172 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	EFNA5	P52803	228 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CDH8	P55286	799 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DYNLT1	P63172	113 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LCT	P09848	1927 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	EDNRB	P24530	442 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CLCN3	P51790	818 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IGBP1	P78318	339 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IER5	Q5VY09	327 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CALB1	P05937	261 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	BRAF	P15056	766 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KLRC2	P26717	231 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ARSE	P51690	589 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CNPY4	Q8N129	248 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GPR20	Q99678	358 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZWILCH	Q9H900	591 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	LIAS	O43766	372 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	TJP3	O95049	919 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	HOXC6	P09630	235 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL8	P10145	99 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	CAV1	Q03135	178 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	GPS1	Q13098	491 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MTM1	Q13496	603 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	MPP2	Q14168	576 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	UBR7	Q8N806	425 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-222	ENST00000635152	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2

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