RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MAMSTRQ6ZN01 415 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC1Q9NV70 894 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ERI5 159 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 SYN3O14994 580 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 LRG1P02750 347 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 OSTNP61366 133 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK7Q13164 816 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 STIM1Q13586 685 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA1Q5VX52 437 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 VITQ6UXI7 678 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP72Q9P209 647 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTN3Q9P232 1028 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD3A2A2Y4 597 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 NCAM2O15394 837 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 AP5Z1O43299 807 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 HS1BP3Q53T59 392 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4F11Q9HBI6 524 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP14Q9HCL3 533 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CITO14578 2027 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFHX4Q86UP3 3567 aa26.1■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARPP19P56211 112 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX3P56589 373 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF568Q3ZCX4 644 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A7Q9NVC3 462 aa26.09■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 ELF1P32519 619 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 GPBP1Q86WP2 473 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa26.08■■□□□ 1.77
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD9Q9H8M2 597 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF18P17022 549 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 PRCPP42785 496 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 YARSP54577 528 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ARSHQ5FYA8 562 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCD2Q92925 531 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPRY1Q96DX4 576 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RUSC1Q9BVN2 902 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPV4Q9HBA0 871 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC169A6NNP5 214 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF197O14709 1029 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMA7O14818 248 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 HIP1RO75146 1068 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 MCF2P10911 925 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 GJA1P17302 382 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL9P32969 192 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF75DP51815 510 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 PAK1Q13153 545 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR44Q5JSH3 913 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 BEST2Q8NFU1 509 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC3Q9BY71 257 aa26.07■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C4K7 107 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN2B1O00754 1011 aa26.06■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC10A6Q3KNW5 377 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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