RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622171.1

LINC00649-219, long intergenic non-protein coding RNA 649, human

TSL 5

Gene LINC00649, Length 207 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00649-219	ENST00000622171	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171		R4GN57	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171		H0YCG3	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171		H7C4K7	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171		M0QZQ0	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CLDN5	O00501	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PIR	O00625	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SYN3	O14994	580 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	KLRC4	O43908	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ABLIM3	O94929	683 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	YEATS4	O95619	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	FCAR	P24071	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CYP2F1	P24903	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	LMO2	P25791	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	GABRR2	P28476	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	LRPAP1	P30533	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	GDI1	P31150	447 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	DLG4	P78352	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CREM	Q03060	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TNK2	Q07912	1038 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	STK4	Q13043	487 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	BIRC3	Q13489	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PNOC	Q13519	176 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	LPAL2	Q16609	132 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	DDR2	Q16832	855 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ZNF292	O60281	2723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	LAMA1	P25391	3075 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	EXTL3	O43909	919 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PPP6R2	O75170	966 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC00649-219	ENST00000622171	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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