RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589645.5

ITGA2B-204, Transcript of integrin subunit alpha 2b, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA2B, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2B-204ENST00000589645 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA2B-204ENST00000589645 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA2B-204ENST00000589645 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA2B-204ENST00000589645 PRRG1O14668 218 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ABLIM3O94929 683 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 VNN1O95497 513 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ATICP31939 592 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PIK3CAP42336 1068 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 GCLMP48507 274 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TNNC1P63316 161 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PPP3CAQ08209 521 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ZNF699Q32M78 642 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 GPR149Q86SP6 731 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 MLKLQ8NB16 471 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 MMS19Q96T76 1030 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.08■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 STX10O60499 249 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 HLA-DRAP01903 254 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ATF2P15336 505 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ADCY1Q08828 1119 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 OSTM1Q86WC4 334 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SPATA18Q8TC71 538 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 POMKQ9H5K3 350 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 RWDD2AQ9UIY3 292 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 POLIQ9UNA4 740 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 DOCK8Q8NF50 2099 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 CCL16O15467 120 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SEC24AO95486 1093 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 HOXA9P31269 272 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 GTF2H1P32780 548 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 LHX1P48742 406 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 MXI1P50539 228 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 NLRP12P59046 1061 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 MYL7Q01449 175 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TSPY1Q01534 308 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ZP2Q05996 745 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 GPR17Q13304 367 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 UVSSAQ2YD98 709 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 DPH6Q7L8W6 267 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ADHFE1Q8IWW8 467 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PIDD1Q9HB75 910 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 MTMR11A4FU01 709 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 XYLBO75191 536 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PAPLNO95428 1278 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 VNN2O95498 520 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 PCSK1P29120 753 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 RTL10Q7L3V2 364 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA2B-204ENST00000589645 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms