RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC142Q17RM4 750 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZACNQ401N2 412 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 XKR4Q5GH76 650 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT39Q6A163 491 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCEQ6IPM2 695 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GBP6Q6ZN66 633 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 APBB2Q92870 758 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PGBD4Q96DM1 585 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GALT6Q96L58 329 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CASD1Q96PB1 797 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB7Q9H672 318 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ACP6Q9NPH0 428 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NME7Q9Y5B8 376 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GBF1Q92538 1859 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN1AP35498 2009 aa6.49□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PODXLO00592 558 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 AMHP03971 560 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GYPCP04921 128 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 THP07101 528 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TPM2P07951 284 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 WEE2P0C1S8 567 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPN2P17655 700 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CD58P19256 250 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP14P31944 242 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1G1P47890 313 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNJ6P48051 423 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC11A1P49279 550 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN10P78369 228 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPC3Q13507 836 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SURF1Q15526 300 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 OSTM1Q86WC4 334 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 HACE1Q8IYU2 909 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 BEST2Q8NFU1 509 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NEK11Q8NG66 645 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB20Q9NX57 234 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC3P53804 2025 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO9A1A5B4 782 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC53A6NM62 1247 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 STX10O60499 249 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 DGKIO75912 1065 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF4AO95239 1232 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 EOMESO95936 686 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SKIP12755 728 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 SKILP12757 684 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 USP8P40818 1118 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 ARID5AQ03989 594 aa6.47□□□□□ -1.37
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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