RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF6P49848 677 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SV2CQ496J9 727 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC93AQ86WB7 457 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFP42Q96MM3 310 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MMS19Q96T76 1030 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 GAD1Q99259 594 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS18Q9NS28 235 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 HTTP42858 3142 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ARL5CA6NH57 179 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 KPNA7A9QM74 516 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF4AO95239 1232 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 THP07101 528 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP8P22894 467 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NDST1P52848 882 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 TUBB4BP68371 445 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM189BP81408 668 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS6KA1Q15418 735 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CNGA2Q16280 664 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC8DQ7L1W4 858 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP85Q9BW27 656 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF19AQ9NV58 838 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF14Q9UBS8 474 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTLC1O15269 473 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 SRGAP2O75044 1071 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MLH1P40692 756 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 STILQ15468 1287 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 LIN9Q5TKA1 542 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 DPH6Q7L8W6 267 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX26Q7Z412 305 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 DAAM2Q86T65 1068 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CREG2Q8IUH2 290 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PASD1Q8IV76 773 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 LPPQ93052 612 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 RSAD1Q9HA92 442 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 MIOSQ9NXC5 875 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 AMFRQ9UKV5 643 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP83Q9Y592 693 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-207ENST00000589146 PITPNM1O00562 1244 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CD19P15391 556 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 LILRA4P59901 499 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 HES6Q96HZ4 224 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 C9IYK1 514 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 O00370 1275 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 EOMESO95936 686 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CALB1P05937 261 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX3P23760 479 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 RRM1P23921 792 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SGO2Q562F6 1265 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 COG1Q8WTW3 980 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 PBKQ96KB5 322 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE8P0CG41 777 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ITIH3Q06033 890 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF333Q96JL9 665 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-207ENST00000589146 NME7Q9Y5B8 376 aa24.18■■□□□ 1.46
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