RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 EPC2Q52LR7 807 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 EXTL3O43909 919 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CST8O60676 142 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GPD1P21695 349 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CHI3L2Q15782 390 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 OTULINQ96BN8 352 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 USP31Q70CQ4 1352 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1E1P36543 226 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ITM2BQ9Y287 266 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D4O60343 1298 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 POLBP06746 335 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 TRIP10Q15642 601 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PCSK7Q16549 785 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF677Q86XU0 584 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NSL1Q96IY1 281 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GID8Q9NWU2 228 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 S100A5P33763 92 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 E2F7Q96AV8 911 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PNKPQ96T60 521 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA6Q8N139 1617 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 P4HA2O15460 535 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 IL18RAPO95256 599 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB1P30740 379 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 VEPH1Q14D04 833 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 UBA3Q8TBC4 463 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 DGKIO75912 1065 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RPA1P27694 616 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SOX11P35716 441 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PDP2Q9P2J9 529 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SMAPO00193 183 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 RFC5P40937 340 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ERVK-24P63145 666 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM5Q71RC9 77 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFS3O75489 264 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 BTKQ06187 659 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 THAP2Q9H0W7 228 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PDE5AO76074 875 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HMBSP08397 361 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 LPAR1Q92633 364 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H2ADP20671 130 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 UBE3AQ05086 875 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 IFNEQ86WN2 208 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 NR3C2P08235 984 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PDK1Q15118 436 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRM-211ENST00000580170 CCT7Q99832 543 aa22.27■■□□□ 1.16
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