RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASGEF1CQ8N431 466 aa30.95■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RHOXF2Q9BQY4 288 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELOVL4Q9GZR5 314 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM105AQ9NUU6 356 aa30.95■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SNX9Q9Y5X1 595 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BRD3Q15059 726 aa30.92■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM59LQ9UK28 342 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 GIT1Q9Y2X7 761 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa30.89■■■□□ 2.54
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PQY0 241 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTGESO14684 152 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-208ENST00000573600 GHRP10912 638 aa30.88■■■□□ 2.53
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