RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PROSER1Q86XN7 944 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NUP43Q8NFH3 380 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SPATA18Q8TC71 538 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PPT2Q9UMR5 302 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 FSD2A1L4K1 749 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 H0Y8X5 98 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 F2P00734 622 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CAPNS1P04632 268 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MPOP05164 745 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 GSTM1P09488 218 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 INHBBP09529 407 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MYBP10242 640 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 GUCY2CP25092 1073 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 HOXC13P31276 330 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LIMK1P53667 647 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 STARD6P59095 220 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CYP4F8P98187 520 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 UBE3AQ05086 875 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LAPTM5Q13571 262 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SSPNQ14714 243 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 RTP2Q5QGT7 225 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LILRA6Q6PI73 481 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 LCORLQ8N3X6 602 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 NAT16Q8N8M0 369 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 BRF1Q92994 677 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 BORCS6Q96GS4 357 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC17Q96LX7 622 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 GP6Q9HCN6 339 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SETD4Q9NVD3 440 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 IRAK3Q9Y616 596 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ITPR3Q14573 2671 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 EML5Q05BV3 1969 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ACACAQ13085 2346 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 J3QKU1 62 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ABLIM1O14639 778 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 RECKO95980 971 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TDGF1P13385 188 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PI3P19957 117 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CD247P20963 164 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CD52P31358 61 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 EPHB3P54753 998 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF445P59923 1031 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 GPC5P78333 572 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ATP8B2P98198 1209 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MTAPQ13126 283 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TKFCQ3LXA3 575 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 KCTD1Q719H9 257 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 PANK1Q8TE04 598 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 TCEAL3Q969E4 200 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 JMJD8Q96S16 334 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 MYADMQ96S97 322 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 SLC12A9Q9BXP2 914 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ARMT1Q9H993 441 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD3-210ENST00000561408 CCPG1Q9ULG6 757 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms