RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GIPC1O14908 333 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SCAMP1O15126 338 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EGFRP00533 1210 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 IFNA14P01570 189 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CD4P01730 458 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MX2P20592 715 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CACNB3P54284 484 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 STK4Q13043 487 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EPHA7Q15375 998 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R5EQ16537 467 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf46Q504U0 113 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 IYDQ6PHW0 289 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GPT2Q8TD30 523 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM169Q96HH4 297 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ACAP3Q96P50 834 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KCND2Q9NZV8 630 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB6P35237 376 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G4AP47712 749 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CDR2Q01850 454 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MYL5Q02045 173 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 STILQ15468 1287 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RGS21Q2M5E4 152 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 IRGCQ6NXR0 463 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GANCQ8TET4 914 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0D9SFI3 127 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZW10O43264 779 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ASNA1O43681 348 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NPTXRO95502 500 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SOX5P35711 763 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 THOP1P52888 689 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NFIL3Q16649 462 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP14Q86W24 1093 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CD302Q8IX05 232 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 STAMQ92783 540 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TMX2Q9Y320 296 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF839A8K0R7 811 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SPOPO43791 374 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ZWINTO95229 277 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CHEK2O96017 543 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 ATF6P18850 670 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PRKAR1BP31321 381 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A2P36021 539 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9A3P48764 834 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TBCKQ8TEA7 893 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 KIF12Q96FN5 646 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN10Q9HC96 672 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EVPLLA8MZ36 301 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TOM1L1O75674 476 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TECP42680 631 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 RAPH1Q70E73 1250 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB123Q8N688 67 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 UCMAQ8WVF2 138 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-210ENST00000551525 CCT6BQ92526 530 aa6.6□□□□□ -1.35
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