RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 ING5Q8WYH8 240 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 CGRRF1Q99675 332 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 SOAT2O75908 522 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 CASP4P49662 377 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 TDGQ13569 410 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 OSTM1Q86WC4 334 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 ZNF516Q92618 1163 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 CORO1BQ9BR76 489 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.47■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 HCRTO43612 131 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 EXOC3O60645 756 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 TNNC2P02585 160 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 CEBPBP17676 345 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 PTPN2P17706 415 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 PNOCQ13519 176 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 PARM1Q6UWI2 310 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 METTL23Q86XA0 190 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 FGF14Q92915 247 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-226ENST00000551430 PDXKO00764 312 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 MOSPD3O75425 235 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 NR3C1P04150 777 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 KCNB1Q14721 858 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 CCDC142Q17RM4 750 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 HPDLQ96IR7 371 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 FNBP1Q96RU3 617 aa22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 TNNI1P19237 187 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 EPHA5P54756 1037 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 LRRC3Q9BY71 257 aa22.44■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 GABRDO14764 452 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 HUS1O60921 280 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 TMC8Q8IU68 726 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 PKMYT1Q99640 499 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ATF6P18850 670 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 DLG4P78352 724 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 CLDN10P78369 228 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 FBXL6Q8N531 539 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 NXPE3Q969Y0 559 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 GJA1P17302 382 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 MYO1EQ12965 1108 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 IQCEQ6IPM2 695 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CS-226ENST00000551430 ELMOD1Q8N336 334 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms