RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH7Q9ULB5 785 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 USP20Q9Y2K6 914 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CITO14578 2027 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GVL5 298 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO9A1A5B4 782 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C2CD4DB7Z1M9 353 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PIRO00625 290 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PDXKO00764 312 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL16O15467 120 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 B4GALT3O60512 393 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KINO60870 393 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF202O95125 648 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP11A1P05108 521 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EDN1P05305 212 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA31D3P0C874 917 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC25CP30307 473 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ADSSP30520 456 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ATICP31939 592 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFSF9P41273 254 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TNNC1P63316 161 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AMPD2Q01433 879 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ROR1Q01973 937 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ENPEPQ07075 957 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY1Q08828 1119 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 CETN1Q12798 172 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R5DQ14738 602 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB6Q15916 424 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SEZ6Q53EL9 994 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC39CQ8N584 583 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SAAL1Q96ER3 474 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 BORCS6Q96GS4 357 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 B3GALT6Q96L58 329 aa6.03□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 FIZ1Q96SL8 496 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MMS19Q96T76 1030 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ACBD6Q9BR61 282 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX25Q9H3E2 840 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNK12Q9HB15 430 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCB6Q9NP58 842 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT16Q9UBV4 365 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MYO10Q9HD67 2058 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP8B3O60423 1300 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087X0B3 334 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR27A2RRH5 827 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SOBPA7XYQ1 873 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 F8W810 466 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 IKBKBO14920 756 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPK13O15264 365 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM189A1O60320 539 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RFPL2O75678 378 aa6.02□□□□□ -1.45
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CLSTN3-215ENST00000544584 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGB3P05106 788 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RHOP08100 348 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 NFICP08651 508 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 SRFP11831 508 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMP2P13473 410 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 ANXA13P27216 316 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEA9P43362 315 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP3CCP48454 512 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP2J2P51589 502 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 BFSP1Q12934 665 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 BIRC3Q13489 604 aa6.02□□□□□ -1.45
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNB1Q14721 858 aa6.02□□□□□ -1.45
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