RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 OR4Q2P0C623 313 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 MYL4P12829 197 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ID4P47928 161 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 GUCY2FP51841 1108 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ALCAMQ13740 583 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 TEAD2Q15562 447 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ADALQ6DHV7 355 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 USP49Q70CQ1 688 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SPATA18Q8TC71 538 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 NCANO14594 1321 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.18■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ZNF263O14978 683 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 GDI1P31150 447 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ACOT2P49753 483 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 TAF6P49848 677 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 GRM2Q14416 872 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 DPP3Q9NY33 737 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 CLIC4Q9Y696 253 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.17■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 PNPLA4P41247 253 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 VIPR2P41587 438 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 MTAPQ13126 283 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 RESTQ13127 1097 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SFR1Q86XK3 245 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.16■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 A0A1W2PRU2 124 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SYT1P21579 422 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 GARTP22102 1010 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 NRLP54845 237 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 PPP2R5DQ14738 602 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SLC39A14Q15043 492 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 SV2BQ7L1I2 683 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 FAM3CQ92520 227 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 IL21Q9HBE4 155 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.15■□□□□ 0.82
LTBR-211ENST00000543190 PTPRDP23468 1912 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 MYMKA6NI61 221 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 KPNA7A9QM74 516 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TISP43B9A030 160 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CHRNB1P11230 501 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 GJA1P17302 382 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ATF6P18850 670 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CDC25CP30307 473 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TXLNAP40222 546 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PLCB2Q00722 1185 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SV2CQ496J9 727 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 METTL23Q86XA0 190 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CXorf38Q8TB03 319 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ZNF560Q96MR9 790 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TMEM209Q96SK2 561 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.14■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CYB561D2O14569 222 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 HOXA6P31267 233 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CCR3P51677 355 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 VEPH1Q14D04 833 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 FAM212AQ96EL1 285 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ACCSQ96QU6 501 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TASP1Q9H6P5 420 aa20.13■□□□□ 0.81
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