RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 GDAP2Q9NXN4 497 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CEP72Q9P209 647 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 SORCS3Q9UPU3 1222 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 SOAT2O75908 522 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 RHOP08100 348 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CENPPQ6IPU0 288 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 OSTM1Q86WC4 334 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM174Q8WUU8 243 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 ING5Q8WYH8 240 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 HPDLQ96IR7 371 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TECTAO75443 2155 aa26.73■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 MYO10Q9HD67 2058 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 LAMP2P13473 410 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 DLG4P78352 724 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 MTMR3Q13615 1198 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 FGF13Q92913 245 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CORO1BQ9BR76 489 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 MAFFQ9ULX9 164 aa26.72■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 PRR33A8MZF0 331 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CCR2P41597 374 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC142Q17RM4 750 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 SOWAHAQ2M3V2 549 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CEP135Q66GS9 1140 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 PARD3BQ8TEW8 1205 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TCEAL4Q96EI5 215 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 ASIC4Q96FT7 647 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 TIGD1Q96MW7 591 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CDH7Q9ULB5 785 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.71■■□□□ 1.87
TM7SF3-210ENST00000542019 CALUO43852 315 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 HUS1O60921 280 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 PTPN2P17706 415 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 SIGLEC14Q08ET2 396 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 NPAS3Q8IXF0 933 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 SPATA20Q8TB22 786 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM221A6NGB7 291 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 M0R296 226 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 CEBPBP17676 345 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 MYO1EQ12965 1108 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 LIMS2Q7Z4I7 341 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 TOP6BLQ8N6T0 577 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 AKAP3O75969 853 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 KIF20AO95235 890 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 NR2F2P24468 414 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 PRCPP42785 496 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 MYL6P60660 151 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 CLDN10P78369 228 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 HTR4Q13639 388 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 C1orf220Q5T0J3 134 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 PKMYT1Q99640 499 aa26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 ANHXE9PGG2 379 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 GABRDO14764 452 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 MOSPD3O75425 235 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 COL9A1P20849 921 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 TDGQ13569 410 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 NFIL3Q16649 462 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 PARM1Q6UWI2 310 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 FGF14Q92915 247 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 SMARCE1Q969G3 411 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 GSDMAQ96QA5 445 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRC3Q9BY71 257 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 RMND1Q9NWS8 449 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 NME7Q9Y5B8 376 aa26.67■■□□□ 1.86
TM7SF3-210ENST00000542019 NUMBLQ9Y6R0 609 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms