RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	NPR3	P17342	541 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GPC5	P78333	572 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TSPY1	Q01534	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TCF15	Q12870	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TAF12	Q16514	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MYL1	P05976	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PFKFB1	P16118	471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CMA1	P23946	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CASP1	P29466	404 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CYP2J2	P51589	502 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHA5	P54756	1037 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	WNT7B	P56706	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MYL7	Q01449	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CUL4B	Q13620	913 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SCN1A	P35498	2009 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1B0GVL5	298 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393		H0Y858	1186 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	VNN2	O95498	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TNNI1	P19237	187 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXD13	P35453	343 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CCR2	P41597	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	EHHADH	Q08426	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PSMD2	Q13200	908 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PSMG2	Q969U7	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PRU2	124 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	CLIC2	O15247	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PI15	O43692	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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